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- Basler Kommentar zur schweizerischen Strafprozessordnung (StPO) und Jugendstrafprozessordnung (JStPO) (Marcel Niggli/Marianne Heer/Hans Wiprächtiger, Hrsg.), Art. 220-233 StPO (Haftrecht), Band II, 3. Aufl., Basel 2023.
- Kriminalpolitik und Kriminalpraxis vor alten und neuen Herausforderungen. -- Back to the Future or Forward to the Past? Perspektivenwechsel im
Strafrecht zwischen Repressionserwartungen, Cybercrime, Kriminalisierung der Alltagssexualität, Verhüllungsverboten und Corona, in: Genillod et
al. (Hrsg), Von Repression zu Prävention: Antagonistische oder komplementäre Logiken? SAK Tagungsband Nr. 39, Basel 2022, S. 3 ff.
- Strafrecht, Justiz und Menschenrechte in Zeiten von Covid-19. Zum Virus der medialen Aufgeregtheit, SJZ 116 (2020) Nr. 13 S. 451 ff.
- Basler Kommentar zum Schweizerischen Strafgesetzbuch (StGB) (Marcel Niggli/Hans Wiprächtiger, Hrsg.), Vor Art. 24-Art. 27 StGB (Teilnahme), Band I, Art. 1-136 StGB, JStG, 4. Aufl., Basel 2019.
- Basler Kommentar zum Bundesgerichtsgesetz (BGG) (Marcel Niggli/Peter Uebersax/Hans Wiprächtiger/lorenz Kneubühler, Hrsg.), Art. 43, Art. 84, Art. 100 Abs. 2 lit. b, Art. 103 Abs. 2 lit. c und Art. 107 Abs. 3 BGG (internationale Strafrechtshilfe), 3. Aufl., Basel 2018.
- Gemeingefährliches Haftrecht? Zur Teilrevision des strafprozessualen Haftrechts gemäss dem
Vorentwurf von 2017, Jusletter 26. März 2018.
- Antennensuchlauf und rückwirkende Randdatenerhebung bei Dritten, Bundesgerichtspraxis und
gesetzliche Lücken betreffend Art. 273 und Art. 270 lit. b StPO, in: Daniel Jositsch/Christian Schwarzenegger/Wolfgang Wohlers (Hrsg.), Festschrift für Andreas Donatsch zum 65. Geburtstag, Zürich
2017, S. 357-367.
- Basler Kommentar Internationales Strafrecht (IRSG, GwUe) (Marcel Niggli/Stefan Heimgartner, Hrsg.), Art. 3 Abs. 1-2 (politisches Delikt), Art.
44-48 und Art. 50-51 (Auslieferungshaft) IRSG, Art. 18-20 und Art. 25-28 GwUe, Basel 2015.
- Kettenanstiftung durch einen "Blick"-Journalisten zur Verletzung des Amtsgeheimnisses: Auch die blosse Anfrage um "Unterstützung" kann strafbar sein, Urteilsanmerkungen KGer/SG, 24.11.2014, medialex 2015 Nr. 10.
- Marksteine der Bundesgerichtspraxis zur strafprozessualen Überwachung des digitalen Fernmeldeverkehrs. Probleme der grenzüberschreitenden Strafverfolgung bei Delikten über soziale Netzwerke und den mobilen Internetverkehr, in: Gschwend/Hettich/Müller-Chen/Schindler/Wildhaber (Hrsg.), Recht im digitalen Zeitalter, Festgabe Schweizerischer Juristentag 2015 in St.Gallen, Zürich 2015, S. 615-635.
- Basler Kommentar zur schweizerischen Strafprozessordnung (StPO) und Jugendstrafprozessordnung (JStPO) (Marcel Niggli/Marianne Heer/Hans Wiprächtiger, Hrsg.), Art. 220-233 StPO (Haftrecht), Band II, 2. Aufl., Basel 2014.
- Fall Perinçek: der Europäische Gerichtshof stellt das Leugnen des Genozids an den Armeniern unter den Schutz der Menschenrechte
-- Ein
Diskussionsbeitrag, Forum poenale 2014 S. 53 ff.
- Basler Kommentar zum Schweizerischen Strafgesetzbuch
(StGB) (Marcel Niggli/Hans Wiprächtiger, Hrsg.), Vor Art. 24-Art. 27 StGB (Teilnahme), Band I, Art. 1-110 StGB, JStG, 3. Aufl., Basel
2013.
- Das Haftrecht der neuen StPO auf dem Prüfstand der Praxis, Entwicklungen bei
den Haftgründen und vorläufiger Rechtsschutz bei Haftentlassungen, Schweizerische Zeitschrift für Strafrecht, Bd. 130 (2012) S. 334 ff.
- Basler Kommentar zum Bundesgerichtsgesetz (BGG) (Marcel Niggli/Peter Uebersax/Hans Wiprächtiger, Hrsg., in Koautorenschaft mit Heinz Aemisegger), Art. 43, Art. 79, Art. 84, Art. 100 Abs. 2 lit. b, Art. 103 Abs. 2 lit. c und Art. 107 Abs. 3 BGG (internationale Strafrechtshilfe, Zwangsmassnahmenbeschwerde bei Bundesgerichtsbarkeit), 2. Auflage, Basel 2011.
- Basler Kommentar zur schweizerischen Strafprozessordnung (StPO) und Jugendstrafprozessordnung (JStPO) (Marcel Niggli/Marianne Heer/Hans Wiprächtiger, Hrsg.), Art. 220-233 StPO (Haftrecht), Basel 2011.
- Ausgewählte Fragen der strafprozessualen Haft nach neuer StPO, in: Marianne Heer (Hrsg.), Schweizerische StPO und Schweizerische JStPO, Bern 2010, S. 173 ff.
- Berner Kommentar zum schweizerischen Zollgesetz (ZG) (Martin Kocher/ Diego Clavadetscher, Hrsg.), Art. 101 und Art. 105 ZG (Festnahme/Haftrecht), Bern 2008.
- Basler Kommentar zum Bundesgerichtsgesetz (BGG) (Marcel
Niggli/Peter Uebersax/Hans Wiprächtiger, Hrsg., in Koautorenschaft mit
Heinz Aemisegger), Art.
43, Art. 79, Art. 84, Art. 100 Abs. 2 lit. b, Art. 103 Abs. 2 lit. c und Art. 107 Abs. 3 BGG (internationale Strafrechtshilfe, Zwangsmassnahmenbeschwerde bei Bundesgerichtsbarkeit), Basel 2008.
- Internationales Strafrecht im Spannungsfeld der Weltpolitik. Zu den rechtshistorischen und geopolitischen Hintergründen der Auslieferungsfälle Adamov, Kosovo und kurdischer Widerstand, in: Universität St. Gallen (Hrsg), Rechtliche Rahmenbedingungen des Wirtschaftsstandortes Schweiz, Festschrift 25 Jahre juristische Abschlüsse an der Universität St. Gallen (HSG), Zürich 2007, S. 165 ff.
- Basler Kommentar zum Schweizerischen Strafgesetzbuch (StGB) (Marcel Niggli/Hans Wiprächtiger, Hrsg.), Vor Art. 24-Art. 27 StGB (Teilnahme), Band I, Art. 1-110 StGB, JStG, 2. Aufl., Basel 2007.
- Terroristischer Massenmord an Zivilisten als "legitimer Freiheitskampf" (im Sinne von Art. 260quinquies Abs. 3 StGB) kraft "Analogieverbot"? Ein Diskussionsbeitrag zu ZStrR 123 (2005) 458-470, ZStrR 124 (2006) 331 ff.
- Internationale Rechtshilfe bei Geldwäschereiverdacht. Entwicklung und Typologie der bundesgerichtlichen Praxis zur Konkretisierung der verbrecherischen Vortat, ZStrR 124 (2006) 274 ff.
- Zur Abgrenzung zwischen Terroristen und militanten "politischen" Widerstandskämpfern im internationalen Strafrecht. Am Beispiel des serbisch-kosovoalbanischen Bürgerkrieges, ZBJV 2005, S. 213 ff.
- Die Rechte der Inhaftierten – Neue Entwicklungen in der Gesetzgebung und Rechtsprechung, in: Franz Riklin (Hrsg.), Von der Verhaftung bis zum Vollzug – Grenzen der staatlichen Gewalt, Fachgruppe Reform im Strafwesen der Caritas Schweiz, Luzern 2004, S. 53 ff.
- Lebenslange Verwahrung: Zur grundrechtskonformen Auslegung von Art. 123a BV, AJP 2004, S. 418 ff.
- Die Strafbarkeit der Unterstützung (insbesondere Finanzierung) des Terrorismus. Al-Qaïda, ETA, Brigate Rosse – das schweizerische Antiterrorismus-Strafrecht auf dem Prüfstand, ZStrR 121 (2003) 423 ff.
- Gefangenenrechte und Polizeigewalt, plädoyer 2003 Nr. 6, S. 30 ff.
- Basler Kommentar zum Schweizerischen Strafgesetzbuch (StGB) (Marcel Niggli/Hans Wiprächtiger, Hrsg.), Vor Art. 24-Art. 27 StGB (Teilnahme), Band I, Art. 1-110 StGB, Basel 2003.
- Andreas Donatsch/Marc Forster/Christian Schwarzenegger (Hrsg.): Strafrecht, Strafprozessrecht und Menschenrechte, Festschrift für Stefan Trechsel zum 65. Geburtstag, 909 Seiten, Zürich 2002.
- "Kurzer Prozess". Die Unschuldsvermutung bei Kostenauflage an Nichtverurteilte. Rechtsstaatliche Fallstricke in der Bundesgerichts-praxis zur Vermutung der Schuldlosigkeit, in: Strafrecht, Strafpro-zessrecht und Menschenrechte, Festschrift für Stefan Trechsel, Zürich 2002, S. 691 ff.
- Der Wirtschaftsalltag als strafrechtsdogmatischer "Hort des Verbrechens". Zum "zielobjektivierten Beihilfetatbestand" bei sogenannten "Alltagsgeschäften" und berufstypischen Dienstleistungen, in: Wirtschaft und Strafrecht, Festschrift für Niklaus Schmid, Zürich 2001, S. 127 ff.
- Die Internationalisierung des Strafrechts und der Verteidigungsrechte. Verfahrensvorschriften internationaler Strafgerichte im Lichte der Vorarbeiten zu einer Eidgenössischen Strafprozess-ordnung, in: Recht und Internationalisierung, St. Galler Festgabe zum Schweizerischen Juristentag 2000, Zürich 2000, S. 309 ff.
- Straffung des Verfahrens, eingeschränkter Rechtsschutz: Die Praxis nach der Revision des Bundesgesetzes über die internationale Rechtshilfe in Strafsachen, Anwaltsrevue 1999 Nr. 6/7 S. 12 ff.
- Kollektive Kriminalität. Das Strafrecht vor der Herausforderung durch das organisierte Verbrechen, Bibliothek zur Zeitschrift für Schweizerisches Recht, Beiheft 27, Basel 1998.
- Le droit pénal devant le défi du crime organisé. Revue internationale de droit pénal 1997 (AIDP), 981 ff.
- StGB-Revision Allgemeiner Teil: ein gelungener Entwurf. Plädoyer 1998 Nr. 6, S. 28 ff.
- Rechtsschutz bei strafprozessualer Haft, SJZ 94 (1998) 2 ff. (erster Teil)/35 ff. (zweiter Teil).
- Die staatsrechtliche Beschwerde, in:Thomas Geiser/Peter Münch (Hrsg.), Prozessieren vor Bundesgericht, Handbücher für die Anwaltspraxis, Bd. 1, 2. Aufl., Basel 1998, S. 53 ff.
- Le droit pénal devant le défi du crime organisé, Rapport suisse pour la Conférence de l'Association Internationale de Droit Pénal à Naples, 17-20 septembre 1997, Revue Internationale de Droit Pénal (RIDP) 68 (1997) 981 ff.
- Kettentheorie der strafprozessualen Beweiswürdigung. "In dubio pro reo" vor Bundesgericht – Zum Prüfungsprogramm bei der Rüge willkürlicher Beweiswürdigung, ZStrR 115 (1997) 61 ff.
- Zur strafprozessualen Zeugnis- und Aktenherausgabepflicht der Revisoren, Der Schweizer Treuhänder 70 (1996) 491 ff.
- Die staatsrechtliche Beschwerde, in: Thomas Geiser/Peter Münch (Hrsg.), Prozessieren vor Bundesgericht, Handbücher für die Anwaltspraxis, Bd. 1, Basel 1996, S. 41 ff.
- Schutz der Strafjustiz vor diffamierenden Angriffen. Impliziert das Recht auf freien Briefverkehr ein "Menschenrecht" auf Verbreitung massiver Ehrverletzungen? Kritische Anmerkungen zum Bericht der Europäischen Menschenrechtskommission im Fall Stürm, recht 1996 S. 203 ff.
- Empirische Erkenntnisse zur strafprozessualen Haft. Streiflichter hinter die Mauern der Untersuchungsgefängnisse, AJP 1996 Nr. 12 S. 1522 ff.
- Die Korrektur des strafrechtlichen Rechtsgüter- und Sanktionenkataloges im gesellschaftlichen Wandel, Politisierung des Strafrechts und Kriminalisierung des Alltagslebens, Habilitationsschrift der Universität St. Gallen 1995 = ZSR NF 114 II (1995) 1 ff.
- Bedeutung und Funktion des juristischen Zitats. Rechtsvergleichende Bestrebungen zur Vereinheitlichung der Zitierpraxis, in: Rapports suisses présentés au XIVème Congrès international de droit comparé, Athènes 1994, Veröffentlichungen des Schweizerischen Instituts für Rechtsvergleichung, Bd. 24, Zürich 1994, S. 35 ff.
- European Constitutional Law in Action: Visiting a Public Debate at the Swiss Federal Supreme Court, Indiana International and Comparative Law Review, vol. 3 (1993) 265 ff.
- Rechtsfortbildung am Bundesgericht im Spannungsfeld von Kritik und Rezeption, in: Geschlossene Gesellschaft? Macht und Ohnmacht der Justizkritik, Zürich 1993, S. 137 ff.
- Woran staatsrechtliche Beschwerden scheitern. Zur Eintretenspraxis des Bundesgerichtes, SJZ 89 (1993) 77 ff.
- Die Bundesgerichtspraxis zur strafrechtlichen Unschuldsvermutung – Marschhalt oder Ende einer Odyssee? ZBJV 129 (1993) 428 ff.
- Der Anspruch auf unentgeltliche Rechtsverbeiständung in der neueren bundesgerichtlichen Rechtsprechung, ZBl 93 (1992) 457 ff.
- Die Verwertbarkeit der Zeugenaussagen von Drogensüchtigen, AJP 1992 (Nr. 8) S. 987 ff.
- Die Bedeutung der Kritik an der bundesgerichtlichen Praxis. Elemente einer allgemeinen Rezeptionstheorie unter besonderer Berücksichtigung der Bundesgerichtspraxis zur Verbrechenslehre, Dissertation der Universität St.Gallen 1992, St. Galler Beiträge zum öffentlichen Recht, Bd. 29.
- EMRK als Argument. Die ausdrückliche Berücksichtigung der EMRK bei der Revision der kantonalen Strafprozessgesetze und in der Bundesgerichtspraxis zum Strafprozessrecht, Prätor 1988/89 Nr. 2, S. 37 ff.
- Der Schutz von Computerprogrammen vor "Raubkopien" de lege lata et ferenda, Prätor 1988 Nr. 1, S. 12 ff.
- Positionen der schweizerischen Lehre in der Diskussion um die Straftheorien. Versuch
einer Integration, ZStrR 101 (1984) 242 ff
(Hier nicht aufgelistet: Diverse Buchrezensionen und Urteilsbesprechungen)